秋水仙碱可引起严重恶心、呕吐、腹泻等肠胃道副反应。秋水仙碱引起的腹泻可造成严重的电解质紊乱，尤其在老年人可有严重的后果。合并溃疡病的患者忌口服。此外，应注意如白细胞降低、脱发、肌病、肝肾功能损害等副反应。静脉注射时，应注意缓慢注射(>2～5分钟)，切勿使药物外漏。预防性口服秋水仙碱同时给予静脉注射可引起严重的骨髓抑制，甚至死亡。